奧林巴斯偏光顯微鏡在光學顯微鏡的光學系統中插入了起偏振鏡和檢偏振器，用以檢查樣品的各向異性和雙折射性的顯微鏡。起偏振鏡和檢偏振鏡都是由偏光棱鏡或偏光板的尼科耳(nicol)棱鏡制成。前者安裝在光源與樣品之間，后者安裝在接物鏡與接目鏡之間或接目鏡之上。在生物樣品中，肌肉纖維、骨骼和牙齒等具有各向異性，淀粉粒、染色體和紡錘體等具有雙折射性，因此被用于組織細胞的化學研究。光源好用單波長光線。由于生物樣品比金相、巖石或結晶的雙折射性顯著微弱，所以有時也借敏感的檢偏振板造成的相加相減現象而利用其干涉色。
　　奧林巴斯偏光顯微鏡在各方面的調整：
　　1、起偏振鏡位置的調整
　　起偏鏡一般安裝在可以轉動的圓框內，借助手柄轉動調節，調節的目的是為了使起偏振鏡出來的偏振光動面水平，以保證垂直照明器平面玻璃反射進入物鏡的偏振光強度大，且仍為直線偏振光。
　　調整方法，是將經過拋光而未經腐蝕的不銹鋼試樣(光性均質體)放在載物臺上，除去檢偏振鏡，只裝起偏振鏡，從目鏡內觀察聚焦后試樣磨面上反射光的強度，轉動起偏振鏡，反射光強度發生明暗變化，當反射光強時，就是起偏振鏡振動軸的正確位置。
　　2、檢偏振鏡位置的調整
　　起偏振鏡位置調整好后，裝入檢偏振鏡，調節檢偏振鏡的位置，當在目鏡中觀察到暗的消光現象時，就是檢偏振鏡與偏振鏡正交的位置。在實際觀察中，常將檢偏振鏡作一個小角度的偏轉，以增加顯微組織的襯度。其偏轉的角度由刻度盤上的刻度指示出來。若將檢偏振鏡在正交位置轉動90°，則兩偏振鏡振動軸平行，這時和一般光線下照明的效果相同。
　　許多金相顯微鏡在出廠時已經把起偏振鏡或偏振鏡的振動軸的方向固定好，只要調節另一個偏振鏡的位置就可以了。
　　3、物臺中心位置的調整
　　利用偏振光鑒別物相時，經常需要將載物臺作360°旋轉，為使觀察目標在載物臺旋圍時不離開視域，在使用前必須調節載物臺的機械中心與顯微鏡的光學系統主軸重合。一般是通過載物臺上的對中螺釘進行調整。