奧林巴斯顯微鏡在通過軟件進行系統配置的情況下，很多成像操作實現了自動化，用戶界面得到簡化，且對操作員的技能要求降低，全電動顯微鏡還可使生產力獲得全面提高。另外全電動顯微鏡還提高了不同操作水平操作員之間圖像和測量的可重復性。軟件的用戶訪問權限還可設定為需要工程級用戶界面的操作者可獲得和使用這些功能，而基本用戶則使用簡化的用戶界面。
奧林巴斯顯微鏡全電動系統的其他功能和優點還包括顯微鏡控制與通信功能的提高，包括觀察方法（BF、DF、DIC）、物鏡選擇、照明條件、以及孔徑控制等顯微鏡功能的控制都得到了提高。奧林巴斯顯微鏡通過軟件或手動開關實現的這一控制功能的提高，可以為操作員帶來很多好處，其中包括：
1、由于在采集圖像時軟件將會反饋正在使用的是哪個物鏡，所以校準獲得保證。
2、通過在軟件中選擇觀察方法可簡化顯微鏡配置操作。該功能可將所有顯微鏡功能根據預設觀察條件自動設定。例如：暗場（DF）條件將會設定分光鏡塔臺為暗場分光鏡，將光源亮度調到大，將光闌打開到大，更換為暗視場物鏡，并且甚至可以設定焦點。
3、可通過圖像軟件（如奧林巴斯Stream™）從所采集的圖像中讀取和加載顯微鏡參數。該功能可以讓您將系統設定成與采集圖像時完全相同的配置參數。
4、由于操作者不用再伸長手進行倍率或成像方法的更改，人體工學獲得改善。
5、由于操作者不再需要在樣品上方進行物鏡或觀察方法的更換，樣品清潔度獲得改善。