奧林巴斯顯微鏡有低倍鏡與高倍鏡之分，對應的操作有大致方向相同，細節上也有稍許的不一樣
　　相同點：
　　在操作奧林巴斯顯微鏡前，我們一定要記得保持周圍的是灰暗的。所以我們在操作顯微鏡之前，記得先把室內的窗簾和燈關上。在得到了合適的環境后才可以打開顯微鏡的汞燈，這也是依據熒光顯微鏡的具體工作原理來進行的具體環境要求。之后我們通過汞燈來觀察物體，才能將這款顯微鏡的性能發揮出來。之后我們要做的就是選擇適當的濾光片，這個濾光片要根據具體要觀察的物體被標記的熒光素來決定。
　　奧林巴斯顯微鏡低倍鏡細節操作：
　　1、取鏡和放置：顯微鏡屬于高精密儀器，取鏡時要特別小心。平時用完顯微鏡，都應該存放在柜子或箱子中，用手去取出，要右手緊握鏡臂，左手托住鏡座，將顯微鏡穩穩的放在自己左肩前方的實驗臺上，鏡座后端距桌邊1-2寸為宜，便于坐著操作。
　　2、對光：用拇指和中指移動旋轉器(切忌手持物鏡移動)，使低倍鏡對準鏡臺的通光孔(當轉動聽到碰叩聲時，說明物鏡光軸已對準鏡筒中心)。打開光圈，上升集光器，并將反光鏡轉向光源，以左眼在目鏡上觀察(右眼睜開),同時調節反光鏡方向，直到視野內的光線均勻明亮為止。
　　3、放置玻片標本：取一玻片標本放在鏡臺上，一定使有蓋玻片的一面朝上，切不可放反，用推片器彈簧夾夾住，然后旋轉推片器螺旋，將所要觀察的部位調到通光孔的正中。
　　4、調節焦距：以左手按逆時針方向轉動粗調節器，使鏡臺緩慢地上升至物鏡距標本片約5毫米處，應注意在上升鏡臺時，切勿在目鏡上觀察。一定要從右側看著鏡臺上升，以免上升過多，造成鏡頭或標本片的損壞。然后，兩眼同時睜開，用左眼在目鏡上觀察，左手順時針方向緩慢轉動粗調節器，使鏡臺緩慢下降，直到視野中出現清晰的物象為止。
　　5、如果物象不在視野中心，可調節推片器將其調到中心(注意移動玻片的方向與視野物象移動的方向是相反的)。如果視野內的亮度不合適，可通過升降集光器的位置或開閉光圈的大小來調節，如果在調節焦距時，鏡臺下降已超過工作距離(>5.40mm)而未見到物象，說明此次操作失敗，則應重新操作，切不可心急而盲目地上升鏡臺。
　　和奧林巴斯顯微鏡低倍鏡不一樣，奧林巴斯顯微鏡高倍鏡的細節操作時這樣的：
　　1、選好目標：一定要先在低倍鏡下把需進一步觀察的部位調到中心，同時把物象調節到清晰的程度，才能進行高倍鏡的觀察。
　　2、轉動轉換器，調換上高倍鏡頭，轉換高倍鏡時轉動速度要慢，并從側面進行觀察(防止高倍鏡頭碰撞玻片)，如高倍鏡頭碰到玻片，說明低倍鏡的焦距沒有調好，應重新操作。
　　3、調節焦距：轉換好高倍鏡后，用左眼在目鏡上觀察，此時一般能見到一個不太清楚的物象，可將細調節器的螺旋逆時針移動約0.5-1圈，即可獲得清晰的物象(切勿用粗調節器!)
　　4、視野的亮度不合適就用集光器和光圈加以調節，如果需要更換玻片標本時，必須順時針(切勿轉錯方向)轉動粗調節器使鏡臺下降，方可取下玻片標本。